DICOM — Digital Imaging and Communications in Medicine (Цифровая визуализация и коммуникации в медицине) — это международный открытый формат изображений для обработки, хранения, печати и передачи информации в медицинских изображениях.
Медицинские изображения используются для идентификации и исследования физических повреждений и заболеваний с помощью таких процедур, как рентгенография, компьютерная томография и т.д.
В этой статье перечислены лучшие бесплатные приложения для Linux, используемые для обработки изображений, генерируемых устройствами DICOM.
1. Amide
Amide — кроссплатформенный GTK+ инструмент для просмотра, регистрации и анализа объемных наборов данных медицинской визуализации.
В программе используется графический интерфейс с большим количеством функций, включая загрузку нескольких наборов данных одновременно, генерацию видеороликов в формате MPEG1, мастер анизотропной фильтрации, пороговую обработку наборов данных независимо и в большом количестве и т.д.
2. DicomBrowser
DicomBrowser — это инспектор и модификатор метаданных DICOM с открытым исходным кодом на языке Java. Оно было разработано исследовательской группой нейроинформатики Вашингтонского университета и отлично справляется с пакетной анонимизацией.
Оно является кроссплатформенным, может одновременно загружать тысячи изображений, а также имеет интерфейс командной строки для скриптового механизма анонимизации.
3. 3DimViewer
3DimViewer — это кроссплатформенный легкий 3D-просмотрщик наборов данных DICOM, написанный на языке C++. Он имеет открытый исходный код и обладает набором функций, включающим ортогональные и мультипланарные виды XY, XZ и YZ, окно с настраиваемой плотностью, импорт нескольких наборов данных DICOM, 3D-визуализацию снимков КТ и МРТ, поверхностное моделирование любых сегментированных тканей, 3D-рендеринг поверхностей и др.
4. dcm4che
В отличие от других продуктов, представленных в этом списке, dcm4che представляет собой основанный на Java набор высокопроизводительных приложений, собранных для предприятий здравоохранения, и используется по всему миру исследователями, как в открытых, так и в коммерческих приложениях.
dcm4che позволяет хранить объекты DICOM любого типа в стандартных файловых системах с полной поддержкой клиент-серверной модели PACS, DICOM IOD’s, нескольких платформ и нескольких профилей интеграции IHE.
Кроме того, dcm4che имеет графический веб-интерфейс для администраторов, интегрированный HL7-сервер, который может работать с типами сообщений ADT, ORU, ORM и др.
5. XMedcon
XMedcon — это инструментарий и библиотека с открытым исходным кодом для преобразования медицинских изображений, разработанная в основном для преобразования реконструированных ядерных медицинских изображений.
С его помощью можно читать неподдерживаемые файлы без сжатия, получать исходные массивы изображений в двоичном формате/ASCII, печатать значения пикселей, записывать PNG для настольных приложений, извлекать/упорядочивать заданные изображения и т.д.
6. Aeskulap
Aeskulap — это программа просмотра медицинских изображений, созданная как альтернатива коммерческим программам просмотра DICOM с открытым исходным кодом и основанная на glademm, gtkmm и gconfmm.
Он может загружать серию DICOM-изображений для просмотра, а также получать их из архивных узлов (они же PACS) по сети.
7. Mango
Mango расшифровывается как Multi-image Analysis GUI и предоставляет инструменты для анализа изображений в сочетании с удобным графическим интерфейсом для навигации.
Он может использоваться для редактирования ROI, суммирования изображений, статистического анализа, рендеринга поверхностей и т.д. Кроме того, можно настраивать фильтры, цветовые таблицы, форматы файлов, работать с плагинами и анализировать другие форматы изображений, такие как MINC, NEMA-DES, NIFTI и NIFTI2.
8. 3D Slicer
3D Slicer — многофункциональное многоплатформенное интегрированное приложение для обработки изображений, медицинской информатики и 3D-визуализации, предназначенное для клинических исследователей, врачей и компьютерных ученых.
3D Slicer можно использовать для сложного ручного редактирования, автоматической сегментации, анализа и визуализации данных диффузионно-тензорной визуализации, чтения и записи изображений DICOM и других форматов, пакетной обработки с использованием фильтрации EMSegment BatchMake e.t.c и многих других функций.
9. SMILI
SMILI (произносится как «смили») — это легкая кроссплатформенная библиотека с открытым исходным кодом, содержащая набор классов для создания приложений обработки медицинских изображений и научной визуализации.
Она имеет как простой графический интерфейс, так и CLI со стандартными алгоритмами обработки изображений и моделей: сглаживание, пороговое выделение, маскирование и т.д.
10. openDICOM.NET
openDICOM.NEt — это проект, реализующий совершенно новый подход к библиотекам DICOM. Он написан на языке C# и включает в себя opendicom-utils для работы со словарями данных в различных форматах.
Среди его возможностей — древовидное представление содержимого ACR-NEMA и DICOM, поддержка экспорта изображений ACR-NEMA и DICOM в различные форматы, просмотр изображений с поддержкой одиночных и множественных кадров, циклический просмотр изображений, известный как режим кино, полноценные словари данных и UID DICOM 2007 и др.
11. Kradview
Kradview — это совместимое с ЯМР, DICOM и рентгеновскими снимками устройство, созданное для Unix-подобных платформ. Его назначение — облегчить визуализацию DICOM-изображений независимо от их размера и степени масштабирования.
Первоначально программа была разработана Давидом Санто Орсеро в рамках его докторской диссертации и доработана Давидом дель Рио Мединой с целью повышения производительности рендеринга.
12. Inobitec DICOM Viewer
Inobitec DICOM Viewer — специализированное программное средство, предназначенное для визуализации и анализа медицинских изображений, хранящихся в формате DICOM.
Программа Inobitec DICOM Viewer отличается удобным интерфейсом, позволяющим медицинским работникам эффективно просматривать, анализировать и интерпретировать медицинские изображения. Программа поддерживает широкий спектр методов визуализации, таких как МРТ, КТ и рентгенография.
Благодаря расширенным возможностям, таким как 3D-рендеринг, многоплоскостная реконструкция и различные инструменты измерения, программа Inobitec DICOM Viewer помогает в точной диагностике, что делает ее ценным помощником для клиницистов и радиологов.
13. Ginkgo CADx
Ginkgo CADx — передовое приложение с открытым исходным кодом, предназначенное для работы с медицинскими изображениями, предоставляет ряд инструментов для визуализации, анализа и интерпретации различных медицинских изображений.
Будь то DICOM, рентгеновские, компьютерные или магнитно-резонансные снимки, это программное обеспечение обеспечивает удобство просмотра и управления. Помимо визуализации, Ginkgo CADx поддерживает различные инструменты улучшения и аннотирования изображений, помогая специалистам в точной диагностике.
