DICOM – Digital Imaging and Communications in Medicine (Цифрова візуалізація та комунікації в медицині) – це міжнародний відкритий формат зображень для оброблення, зберігання, друку та передавання інформації в медичних зображеннях.
Медичні зображення використовуються для ідентифікації та дослідження фізичних ушкоджень і захворювань за допомогою таких процедур, як рентгенографія, комп’ютерна томографія тощо.
У цій статті перераховані найкращі безкоштовні додатки для Linux, які використовуються для обробки зображень, що генеруються пристроями DICOM.
1. Amide
Amide – кросплатформний GTK+ інструмент для перегляду, реєстрації та аналізу об’ємних наборів даних медичної візуалізації.
У програмі використовується графічний інтерфейс із великою кількістю функцій, включно із завантаженням кількох наборів даних одночасно, генерацією відеороликів у форматі MPEG1, майстром анізотропної фільтрації, пороговим опрацюванням наборів даних незалежно і у великій кількості тощо.
2. DicomBrowser
DicomBrowser – це інспектор і модифікатор метаданих DICOM з відкритим вихідним кодом мовою Java. Він був розроблений дослідницькою групою нейроінформатики Вашингтонського університету і чудово справляється з пакетною анонімізацією.
Він є кросплатформним, може одночасно завантажувати тисячі зображень, а також має інтерфейс командного рядка для скриптового механізму анонімізації.
3. 3DimViewer
3DimViewer – це кросплатформний легкий 3D-переглядач наборів даних DICOM, написаний мовою C++. Він має відкритий вихідний код і має набір функцій, що охоплює ортогональні та мультипланарні види XY, XZ і YZ, вікно з настроюваною щільністю, імпорт декількох наборів даних DICOM, 3D-візуалізацію знімків КТ і МРТ, поверхневе моделювання будь-яких сегментованих тканин, 3D-рендерінг поверхонь та ін.
4. dcm4che
На відміну від інших продуктів, представлених у цьому списку, dcm4che являє собою заснований на Java набір високопродуктивних додатків, зібраних для підприємств охорони здоров’я, і використовується по всьому світу дослідниками, як у відкритих, так і в комерційних додатках.
dcm4che дає змогу зберігати об’єкти DICOM будь-якого типу в стандартних файлових системах із повною підтримкою клієнт-серверної моделі PACS, DICOM IOD’s, кількох платформ і кількох профілів інтеграції IHE.
Крім того, dcm4che має графічний веб-інтерфейс для адміністраторів, інтегрований HL7-сервер, який може працювати з типами повідомлень ADT, ORU, ORM тощо.
5. XMedcon
XMedcon – це інструментарій і бібліотека з відкритим вихідним кодом для перетворення медичних зображень, розроблена в основному для перетворення реконструйованих ядерних медичних зображень.
З його допомогою можна читати непідтримувані файли без стиснення, отримувати вихідні масиви зображень у двійковому форматі/ASCII, друкувати значення пікселів, записувати PNG для настільних застосунків, витягати/упорядковувати задані зображення тощо.
6. Aeskulap
Aeskulap – це програма перегляду медичних зображень, створена як альтернатива комерційним програмам перегляду DICOM з відкритим вихідним кодом і заснована на glademm, gtkmm і gconfmm.
Він може завантажувати серію DICOM-зображень для перегляду, а також отримувати їх з архівних вузлів (вони ж PACS) по мережі.
7. Mango
Mango розшифровується як Multi-image Analysis GUI і надає інструменти для аналізу зображень у поєднанні зі зручним графічним інтерфейсом для навігації.
Його можна використовувати для редагування ROI, підсумовування зображень, статистичного аналізу, рендерінгу поверхонь тощо. Крім того, можна налаштовувати фільтри, колірні таблиці, формати файлів, працювати з плагінами та аналізувати інші формати зображень, такі як MINC, NEMA-DES, NIFTI та NIFTI2.
8. 3D Slicer
3D Slicer – багатофункціональний багатоплатформний інтегрований додаток для обробки зображень, медичної інформатики та 3D-візуалізації, призначений для клінічних дослідників, лікарів і комп’ютерних учених.
3D Slicer можна використовувати для складного ручного редагування, автоматичної сегментації, аналізу та візуалізації даних дифузійно-тензорної візуалізації, читання й запису зображень DICOM та інших форматів, пакетного оброблення з використанням фільтрації EMSegment BatchMake e.t.c і багатьох інших функцій.
9. SMILI
SMILI (вимовляється як “смілі”) – це легка кросплатформна бібліотека з відкритим вихідним кодом, що містить набір класів для створення додатків обробки медичних зображень і наукової візуалізації.
Вона має як простий графічний інтерфейс, так і CLI зі стандартними алгоритмами обробки зображень і моделей: згладжування, порогове виділення, маскування тощо.
10. openDICOM.NET
openDICOM.NEt – це проект, що реалізує абсолютно новий підхід до бібліотек DICOM. Він написаний мовою C# і містить opendicom-utils для роботи зі словниками даних у різних форматах.
Серед його можливостей – деревоподібне представлення вмісту ACR-NEMA і DICOM, підтримка експорту зображень ACR-NEMA і DICOM в різні формати, перегляд зображень з підтримкою одиночних і множинних кадрів, циклічний перегляд зображень, відомий як режим кіно, повноцінні словники даних і UID DICOM 2007 та ін.
11. Kradview
Kradview – це сумісний з ЯМР, DICOM і рентгенівськими знімками пристрій, створений для Unix-подібних платформ. Його призначення – полегшити візуалізацію DICOM-зображень незалежно від їхнього розміру і ступеня масштабування.
Спочатку програму розробив Давид Санто Орсеро в рамках своєї докторської дисертації, її доопрацював Давид дель Ріо Медіна, щоб підвищити продуктивність рендерінгу.
12. Inobitec DICOM Viewer
Inobitec DICOM Viewer – спеціалізований програмний засіб, призначений для візуалізації та аналізу медичних зображень, що зберігаються у форматі DICOM.
Програма Inobitec DICOM Viewer вирізняється зручним інтерфейсом, що дає змогу медичним працівникам ефективно переглядати, аналізувати та інтерпретувати медичні зображення. Програма підтримує широкий спектр методів візуалізації, таких як МРТ, КТ і рентгенографія.
Завдяки розширеним можливостям, таким як 3D-рендеринг, багатоплощинна реконструкція і різні інструменти вимірювання, програма Inobitec DICOM Viewer допомагає в точній діагностиці, що робить її цінним помічником для клініцистів і радіологів.
13. Ginkgo CADx
Ginkgo CADx – передовий додаток з відкритим вихідним кодом, призначений для роботи з медичними зображеннями, надає низку інструментів для візуалізації, аналізу та інтерпретації різних медичних зображень.
Будь то DICOM, рентгенівські, комп’ютерні або магнітно-резонансні знімки, це програмне забезпечення забезпечує зручність перегляду та управління. Крім візуалізації, Ginkgo CADx підтримує різні інструменти поліпшення та анотування зображень, допомагаючи фахівцям у точній діагностиці.
